Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms