Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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