Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hoxd10P28359 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms