Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Olfr914-202ENSMUST00000217057 4948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms