Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc8E9PWG2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms