Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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AU015836B2RUM3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AU015836B2RUM3 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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