Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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