Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tlr5Q9JLF7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tlr5Q9JLF7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tlr5Q9JLF7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Tlr5Q9JLF7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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