Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
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Trappc6bQ9D289 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc6bQ9D289 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
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