Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ubqln4Q99NB8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ubqln4Q99NB8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ubqln4Q99NB8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ubqln4Q99NB8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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