Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Apobec3Q99J72 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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