Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop58Q6DFW4 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms