Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm35288-201ENSMUST00000216565 2731 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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