Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox12Q04890 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms