Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp1P97309 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms