Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SgcbP82349 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms