Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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