Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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