Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VdrP48281 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VdrP48281 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VdrP48281 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms