Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gbx2P48031 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms