Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl3P27659 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms