Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a2P20490 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a2P20490 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms