Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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DmdP11531 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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DmdP11531 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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DmdP11531 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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DmdP11531 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DmdP11531 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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DmdP11531 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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DmdP11531 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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DmdP11531 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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DmdP11531 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DmdP11531 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DmdP11531 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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