Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
ChmQ9QXG2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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