Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trim39Q9ESN2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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