Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ifi35Q9D8C4 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ifi35Q9D8C4 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ifi35Q9D8C4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ifi35Q9D8C4 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ifi35Q9D8C4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ifi35Q9D8C4 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ifi35Q9D8C4 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms