Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc47Q9D024 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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