Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm9955Q8CEJ8 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms