Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc22Q8C5N3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cwc22Q8C5N3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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