Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Atg16l1Q8C0J2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Atg16l1Q8C0J2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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