Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF7

Slain1, SLAIN motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slain1Q68FF7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slain1Q68FF7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms