Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms