Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rtl5Q5DTT4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rtl5Q5DTT4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rtl5Q5DTT4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rtl5Q5DTT4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rtl5Q5DTT4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rtl5Q5DTT4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl5Q5DTT4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms