Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms