Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gse1Q3U3C9 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gse1Q3U3C9 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gse1Q3U3C9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms