Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fndc4Q3TR08 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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