Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms