Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grin2bQ01097 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms