Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb2Q00977 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb2Q00977 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms