Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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