Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms