Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UbdP63072 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UbdP63072 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UbdP63072 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UbdP63072 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UbdP63072 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UbdP63072 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
UbdP63072 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms