Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lbx1P52955 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lbx1P52955 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms