Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms