Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc5P32043 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms