Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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