Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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