Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms