Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DmdP11531 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DmdP11531 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DmdP11531 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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DmdP11531 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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DmdP11531 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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DmdP11531 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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DmdP11531 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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DmdP11531 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
DmdP11531 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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