Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprcP06800 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprcP06800 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprcP06800 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprcP06800 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms